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MyoD (Myoblast determination protein)

Organism
Sparus aurata (Gilthead sea bream)
Phylogeny
Paralogs
Sequencing Methods
MyOD-1: Sanger sequencing

MyOD-2: Sanger sequencing
Citations
  • Tan X., Du SJ. (2002). Differential expression of two MyoD genes in fast and slow muscles of gilthead seabream (Sparus aurata). Development Genes and Evolution 212 (5):207-217. doi:10.1007/s00427-002-0224-5.
  • Macqueen DJ., Johnston IA. (2008). An update on MyoD evolution in teleosts and a proposed consensus nomenclature to accommodate the tetraploidization of different vertebrate genomes. PLoS ONE 3(2):E1567. doi:10.1371/journal.pone.0001567.
    		•
    Sequence >AF478568.1 Sparus aurata Myoblast determination Protein-1
    AAACATTTGTTTCCTGATCGTTCACCTCAAAGTTTCATTTATAATTTTTAATTTCTCTCCGTGTTCAGTTTGATCTAAAA
    GTCACATTTCATATCAAGTTAACTCTGAATTACATCCAAGTGTGCCAGTAAAAAGTTATGAAGAACAGGAGAGTAATAAT
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    GGTCCTGGTCCACACGCTGCTGTGAGGGTCCCCGGCCCCCCGCTGTGCCGCTCTGACTCTCTTTGGGGTAATTGTACACT
    AATTACCGTGAAGTTGTAAACCCCTCCTGCTGCCAGCTGATTGGTCAGCCTTCAGCGGACCTCATCACCCTGACCCCGCC
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    GTGGGGCTGAACCATGGAGCTGTCGGATATCTCTTTCCCCATCCCCGCCGCGGATGATTTCTACGATGACCCCTGCTTCA
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    CTACATCGAGTCCCCGCAGGCGCTGCTGCGCGGCGGCCAGGACGACGGCTACTACCCGGTGCTGGAGCACTACAGCGGGG
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    GGGGGTCAGTGGAGACGGATCATGGAGAGCTTCTCCTGCGCGTCTTTACGCACGAACGAGCCGCGAGTTTCACCTTTAAA
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    TTAAAACAGGTTGAACAACGAAATGCGCGCTGCGTCACAACCTGTCATCTCTCTTTAACTGCGATTATTATTTTCATTAT
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    CTTTAACGGACCGAGCTGTCAGTCCAACAGAAGAGGAAGTTACGACAGCAGCTCTTATTTCTCTGAGACTCCAAACGGTG
    AGAAACGACTTTAAATCATATAAAACATTTAATCCAGCAGCCAACAGGCGACTGATGCAGATAATAAACGACTTTACTGC
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    GTGAGCTGCAGTTCAGTCTGCAGCGAAATGTTTAATACTGAAACATCTCAGTTTAATCCAGAAACTCACAAGTTTAGTTG
    AATGAGAAACAAAAGTTTGTGTTCACAGTGAGTTCAGTTATTTTATGCTAACATCAATGTTGATAAAATCACTGATGGAT
    TAAGATTTAACTCAGAGAGTTTGTTTCCTTCTCCACTTATTAACTCAGAATCATTTTGTTTGATGTTAAAATCTAAAACT
    TGATGTTTGCGCCGTTTTGTTCCAGGCGGTCTGAAGAGTGAGCGCAGCTCGGTGGTCTCCAGTCTGGACTGTCTGTCCAG
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    ACAGAAAAGATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAGGTCTCACCTCC
    TGGCCTTCACCTGAGCTCTCAGCAGCATCACAGCCTTCATCAGTGGAGAGTTTCCTGTTTTAAAGATTTTATAGTTATCG
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    CTATTAATGTTTTCATTCAGTCTTAATTCAACAG
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    >AF478569.1 Sparus aurata Myogenic differentiation factor-2
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    CCTTCTGCACTGCTAAATGTTCATTAATAAAAATGTTGTTGTAGGACTGTTTCTAACATTTGATGTAAAAAACAGAATAA
    CATAAACATGAAAAAACAACACCATTATTTTTAAGAGAGGTAAAAACTCTATTGAGCTGGAGACAGTTTTCTGATTTCAA
    AATCTTTATTTTAAAGAAACTTTAACTTCTTCATTCAGGATTTTAAAACTGGATTTGAGAAAATACAGAAACAGATAGTG
    CTGTATTATAAAACATTTTTTTTTTTGTTGCCATCAGTGGCATCATTGAGCCGATTTTCCATGATTTTAAAATGGACTTT
    AAACATGGACTTTTTTATTGCTTCCTTTTTGTCGCTGAGTTTCACCTTCATGAGATCCCCTTCACACACACACACACACA
    CACACACACACACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACACACCCCTCAACCATTGGTCACATACACAAC
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    ACACACTGATCTCCTAGACACATACACTTTCTACTTTATTCATCAGGCCAGCTGACCCTGACAGGAGTTGTTCCTTTCCC
    CTTCTTTCCTTTACCCCTTTTAATCCCTTTATCTTTGTAGTTGGAACAGAAGACACTTTGGGCACACTGTAACCTTTTCT
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    TGTCCGACCTTCCCTTCCCTCTCTCCTCTGCTGATGACCTCTATGATGACCCCTGCTTCAGCACCAGCGACATGAACTTC
    TTTGATGACCTGGATGCCCGGCTGATGCACGCCGGTCTGCTAAAGCCAGAGGACCATCTTCATCACCATCATCATTACCA
    CGTCCCTATCGCAGAGGAGGAGGACGAGCATGTGAGGGCTCCCGGGGGCCTCCACCAGGCGGGGCACTGCCTGCTTTGGG
    CCTGCAAGGCCTGCAAAAGGAAAACTACCCACGCAGACCGGAGGAAAGCGGCAACGATGCGGGAAAGGCGGCGGCTCAGT
    AGAGTCAACGACGCCTTTGAGACCCTGAAGCGCTGCACGGCGTCTAGTCCAAACCAGCGGCTGCCTAAAGTGGACATCCT
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    AACACTACAGCGGGGATTCAGACGCCTCCAGCCCCCGCTCCAACTGCTCTGATGGCATGGTGAGTTCAAGAATAGCTGAA
    TGGTTCAACTGCTGCTGTATGAAATGTTTGGAATGTGTGTAAGATATTTATTTTTGGCCACATTAGTTCAATATATTCTC
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