Home BLAST Help About  

IL-I (Interleukin-I)

Organism
Danio rerio (Zebrafish)
Phylogeny
Synteny
Paralogs
Citations
  • Ogryzko NV., Renshaw SA., Wilson HL. The IL-1 family in fish: swimming through the muddy waters of inflammasome evolution. Developmental and Comparative Immunology 46(1):53-62. doi:10.1016/j.dci.2014.03.008.
  • Angosto D., Montero J., López-Muñoz A., Alcaraz-Pérez F., Bird S., Sarropoulou E., Abellán E., Meseguer J., Sepulcre MP., Mulero V. (2013). Identification and functional characterization of a new IL-1 family member, IL-1Fm2, in most evolutionarily advanced fish. Innate immunity. doi:10.1177/1753425913501011.
  • Data input by Mara Iliopoulou
    		•
    Sequence
    >FM213388.1 Danio rerio Interleukin-1b
    AGCCAACCCTCACACTCGGTGACATCAAATGCAGCTTCCTCTTTCTACTAAATTCTCACATTGACTGGACTTCATAAAGC
    CGTGTGTCAGATTCCGGACTCACAAGTCCTTGTAATATCCACCGAGATCATCATGGCAGCCGAGGTATGTGGAGTTCAGT
    TTGTTAAATGTGTAGCTGATTATGGATACTGCACTATACATAGACGTAATCAGTATCTTATTTTGAAAACGTATCCATTT
    GAAAACATTTGACGTGTGGCTTTTTCTAGGGAAGTCCAGTTTGTGGTGGGGTTAAGCTGTTCCACACTGAATGTGCTGGG
    AAACACTTGTATGAAGTGAAAGGTTTTTTAAACCACAACAAAGGAATGTTTACAAGGTATGTTTGTCTGTTTTTCCTTTA
    TTTATTTATTTCTTCATAAATTCCCATATCCTTAACCTGTCTCCCTTTTTTTCCAGCACGGGAGATAAACTCCTAATGAT
    AAACAACACAAACGTGGAGGATCTGACTCCAACATCATTGGCTGATCTTCTGACTGAAGGATCCGCCTTACTTGTGAGTT
    GCGCCTTCATTCAAAAACACATTCAAAGTCAAAGTCAGCTTGATTGTCAATTCAACCACATGTGCAGGACATACAGAGAA
    TCGAAATTGCTTTACTCTCAGACCCAAGGTGCATACAGTGGTGGAAAGAGTAGTGAAAAATCATACTTTTGTCAAGTACC
    ATTACTTGCTTAAAAATGTTGTGCGAGTAAAAGTATCTGTTGTAAATATTACTCAAATTATAAGTAAATGTAGCCCTTTT
    AAAAGTACTCAAGAGTAGTTAGCAGTGAGTATTACGCTGTGAAAGCTGATGCATTAACATGTAATTTGTGGATGTGTGTG
    TAAACGTAACATTCTGTAGTGCATCTAGTTATTGCCCAGCAGACACACAACGTCATAAGATGTTAATATTAGGTTAGATT
    TAGGTTGACCAAAATTCAGTGTCTAGCCAGCGTCTAGGGACAACGTTATTTTGATCACTAATAACAACTTCAAATGATAT
    TTGGTTGATTTTAGGTTGTGTTGGAAAGTTACCAAAATCCAATGTCGAGCCAACATCTTAAACCAACGTCATGTTGACAT
    CAAAAACTTTTTTGACATTTATTTGTCAGGTATGGCAGCCAAAATCTAGCATCTGATAGACGTCATAGTGGCAACATCCA
    CACAACCCCAAGCTGCAACATCATTAGACGTTGACATTTGGTTGATTTTAAGTTGGATGCTGGACATTGACGTCGCCTGA
    TGTTGAGTTTTGACATCAAAATGATGTTCATTTTCAAACAATATGCAACGTCCCCACAACGTTGGGGATGTCATGTTGAT
    GTCTTGTGCCTGCTGGGTGTTAAAGGCCATTTCGATTATCATACAGTAAACATCCGTCATCTTCTCATCAGTGACATGCA
    TCTAAACAGTCCGGGTCAATGTGTGTGAAGATTTTTGACATCTTGGCCGCTTTTAAAGCTTCCAAACAGTTTGCTGCAAT
    TATAAAGTGCCCATGTCTTGAAGTAGCTCATTATGATGCAATTTACCTTCTATGTGTGATTTGATTGGACAGGAATCACA
    GGTTATTTTTTATTAATGCCCATAGAAAAGAAAAAATAAAGTAGTGACTGCAGGTTGAAGGAAAATAGTGGAGTAAAAGT
    ACAGATACAGCACTACAAATGTACTCAAAGGAAAGTAAAAGTTTTTAAAACTACTCAGTAAATTACAATTCCTGAGAATT
    CCTGCACCAATTGTCCTGCTGTTTTTGTGCTCGGTGCTCTGAAGCGCCGACCAGAAAGTAATAGTTCAAACAGGAAGTGT
    GCTGGGTGTGAGAGGTCCAGAGTGATTTTGCGAGCCCTTTTACTCACTCTGGAAAAGTACAGTTCTTGAAGTGTAGGAAG
    GGTATTCGCTGTACTCTACGGAGGTCGGTTTTGGCAGCTGAGACAAACCAGACGGTTATTGAAATGCAGAGTGCAGGTTA
    AGCCAAAAAAAAAATAATATGATAAAGTGACAGTGTCCTAATTATATACAGGGAGGTAGTATGAGGTAACTAGCAGTCCA
    ATGATACACAAAGTGACCAATGAATGAGTGTGTGTGTTATTTTTCCAATTTAATACACCAAAGACTTCTTTGATTGATCT
    AACTTACTTAAACGTGACCTTTAATAGAAAGAAGTGAAACTGAATGTTTTTGATCACATGTGCTTGTGTGGTTGTTTCAA
    TACTTTTCCAGGATTACATTGTGAAAGTTTATTTTGGAGTAATTACTCGAGGATTAAAACTTGTGTTCTTTCTTCAATCT
    TTACTTTAAATCTTTTTTAGACGATACATCACCCATCCAAAAACAAATCAAATGAAGAGTGTGAATCAGAGGAACTCCGT
    GTCGACAGCAAGGAGCGAACAGTCATGAGTTTCAGCCTGCTGATGGTGAGAGATGTGGAGTTGGAGGCAGATGTGATACC
    GGAATCAGATTCAGAGTGCGAAGATGAAATCGAAGACAAGCTTTTCAGTGACAAAAATCTGCTGATTGTCTCCATGGAAG
    ATGCAAGCTTCAACATGGTTGTAGCTCGAGGTTGTGACCCTGACAACCCTTGCAATGACTGTGGAAAGACCAACTGCCAA
    TTGAATGAAGTTGTCGTCTTGCCTACAAATGCTAAAATTAGCTCTTGTAAGAAATGTGTTGCATTTATCGCCATTTGACT
    GTAAAAATGACAAGAATAAATCCTATGCAGAATGTAAATTAACCCTCTATTTTTTTCAGGTTCTGCAAAGGTTTTGCATT
    TCAAAAAAGAAAAGAAAAACTTGTTTTTGAAGAGTTTATTCAACGAAAAGTATGTCACACCAGATAATCGCCAAATATGT
    TTGAGTAGCACCATGTCAGGTCAGTATCAAAAAGTATTCTTGTACTCATTTTGAAACTGCCCTATTTCCATAACACTGCT
    TTATCTTTGCCTGCCCAATCTTTCATCTAAACAAAATTACACTTATTTGTTTACAACTTAGATTTTTAAGTTGCAGTGTG
    CTACATTATAATAATATTATTTATTTCCCAGTACTGGGTTGTAGCTGGAGGGGCATACGCTGTGTAAAGCATATTCCAGA
    ATATTTGGTACTTCATTCGTCTGTGGGGACCACTGATAATTAAGAGACTAAGCCAAAGTAAAATTAATAAATGAATGAAA
    TATAATTTACAATGCCTCATGTTTTTTTCCACCAGCACCAATTACCATCTACTCTTACCGTGTCAACTCAGTGGACAATC
    CAGGTGTTCCTGTTGTGTTGAACTTCACTGGAACACAAAACTTTTTCAGCTGCACCACGAAGCAAGGTGCAGACACGAAG
    ATTTTAACCGTTGTGGTAAGTCATTGTTCATTGCTGATGTATTGTTATGTTGAAGATTATAACAGAGTTTAGAAAGCATT
    ATTAGGTCGGGGTTGTGATTTGAGTATTTGAACTCAAGACACTTAAAAATAAATATGTATTCACCCTCACGTCCTTCCAA
    ACCCATTCAGGATATTTCATTAATTCGTTCATTTTCTTTTTTAAGCTTAGTCTCTTTATTAATCAGGGGTCACCACAGCG
    GAATGAACCGCTAAATTATCCAGCATATGTTTTGCGCAGCGGATGCTTTTCCAGCTGCAACCCAGCACTGGGAAACACCC
    ATATACTCTTGCATTCACACACATACATACACTGACAATTTAGCTTATTCAATTCACCTGTACCGCATGTTTTTGGACTG
    TGAGGGAAACCGGAGCACCTGGGGGAAACCCACGTGAACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAAAAATGACTGA
    CCAAGCTGGGGCTGAAACCAGCAACCTTCTTGCTGGGAGGTGATCCTGCTACCCACTGCACCACCATAATGCCACCATTT
    TTAAAGATTTTTTGTTTTCATTTAGAAAAAACCCCAGTAAAATCTATTTTATCTTTTCCATTCCAAGGTTTTTGTTGCAA
    AACTCCTGAGGATTTTTTTACAGTATTGCTCAGCAGTTAGCTAGCTATTCAAATTAAAGATTTAATGATTTGGTTTATTA
    ATGTAAAGGCTTGTGCACACCAGGATGATTTCGGCTTGAGCTTATAGTTCGCATTTATCTGTGTTCGTAACCATGTTATT
    TTCACTGTCAATTAGCAGAGTGGACGTGCAAAATCCCTTCCTAATATTAAAAAGCACTTTGTGAAAATAATTTTACACTT
    CTGTCACTCGTTTGTTGCACAGAAAAAGCTTCTTTCTTGTTTATTTATTGCATAAGCTTTTTTTAGTTCTGTTTCAAATC
    CTACAACTACAGCACACATTCAAATGTTTGCAGGAAAAAATTGCAAGCTATGAAATCAAATGAAGTGAAACTTACCATCA
    AATCCTATCTGAACTGCAGTTCCTGGGTGGTGCTTAAACACAAAATGGTCTAGCCAAGCAAAATAAAATGTTTGGTCCCA
    CTTTATATTAAATGGCCTTAACTAATATGTACTTACACAGGAATTAATAGTTTGTTACAATGTACTTATTGTGTAAATAC
    ATGTATGTACTGTGTACTTATGCTTGATTAAATACATGTATGTAATTACATCTGTAATTAACTTTTGTAATTACATTTGT
    AAATACACTGTTGACCATCCCCTACACCTTAACCCACCCTTAAACCTACCCATGCCACCAAACCTGTTCATGACCCAACC
    TCTATCCCAACTCAAAAGCACCACAAGTGTTCACAAATACATTATAAACACAGTAAGTACATTGTATTTATTTTTATGTA
    AGTACATAGTAGTTAAGGACACTTAATATAAAGTGGGACCAAATGTTTTAATGTCAGTTCAGCAGCTAAAGGCTCATGAA
    CAGAAGCACCAATCTCCTTGGTCAACCAGTTTTAATGCAGCGGGTCAAATACATTTATTGCCATTCTTCTGTTAGTGTAA
    ACACTCAAATTATCAGCCTTTTAGTCACAAAGTGTTAAACATCATTAAACATCATTGATAAGTAGGTAACACTTTACAAT
    AAGATTGTATTAATGTTACCTAATTGGTTTACTAACATGAACAAACAATGAACCATACATTGTTACAGTATTTGTTCATG
    TTAGTTAATGTAAGGTAATGAAAAAACAATTGTTCATTGTTAGTTCATGTTTACTCACAGCGTGTTAACTAATGTAAACA
    ACATGAATTTGGATGTGAATAATGCATTAGTAAATGTTGAACTATGATTAATAGATGATGTACAGGTATTGTTCATAATT
    ACTTAATGTTAGTAAATACATTATCATGAACTAATAAAATCTTATTGTAAAGAGTGACTGATAAGAGCAAGTCAATATAT
    TTCTGGTTTGCACAGGCAACTTTGGTTTAAATAGTATGGTGGTAATTTTTGTTTTTATTATTAGATTTTTGTAATGTCTG
    AGAATATTTTTTAATGTTAAAGGAATTAAAAGAAATACTACTTCCAAGATACCATAAGCATGTGCTGACTTCCATTAAAC
    ATGGTATGTGTGCTGTCTTTCAGTCTTACAGTAAGAGCGAGCTGCAAAAGATCTGCGCCGGGGACACAGAGAAATGGTCA
    CTTGTGTTCTACAAGTCTTGTGGACCAGACTGTTTCCAACGGTTTGAGTCGGCTCTCCACAGAGGATGGTTTATCTGCAC
    CAAAAATATTGCCAACAATGACGCGAATGTGTACATGGGCAAAGGTGTTGAGCGTGACAAACCACTCAACACCTTTTTCG
    TCATAATTGAGAGTGAGAAAGCGATTTGCTAAAAGCGTCACAGTGATGTAACGTTTTTGTGCAGTAGATGTATACTGTAT
    GTCTTGCATTAAGAGTTATGATATTTTCTTTATGAGCTATTCTCTAATTAATGTCTTACAGACACAATACAGACACAATA
    AGCTGACATTACTATCTAACACGATCAAAAGCCTATAGTGCTTTATTAAAAGTCTGAATAAATTTTTTGGATTGGCAACT
    Send to
    		or


    >NM_001290418.1 Danio rerio Interleukin-1 family member
    ATGGCAGCCGAGGGAAGTCCAGTTTGTGGTGGGGTTAAGCTGTTCCACACTGAATGTGCTGGGAAACACTTGTATGAAGT
    GAAAGGTTTTTTAAACCACAACAAAGGAATGTTTACAAGCACGGGAGATAAACTCCTAATGATAAACAACACAAACGTGG
    AGGATCTGACTCCAACATCATTGGCTGATCTTCTGACTGAAGGATCCGCCTTACTTACGATACATCACCCATCCAAAAAC
    AAATCAAATGAAGAGTGTGAATCAGAGGAACTCCGTGTCGACAGCAAGGAGCGAACAGTCATGAGTTTCAGCCTGCTGAT
    GGTGAGAGATGTGGAGTTGGAGGCAGATGTGATACCGGAATCAGATTCAGAGTGCGAAGATGAAATCGAAGACAAGCTTT
    TCAGTGACAAAAATCTGCTGATTGTCTCCATGGAAGATGCAAGCTTCAACATGGTTGTAGCTCGAGGTTGTGACCCTGAC
    AACCCTTGCAATGACTGTGGAAAGACCAACTGCCAATTGAATGAAGTTGTCGTCTTGCCTACAAATGCTAAAATTAGCTC
    TTGTTCTGCAAAGGTTTTGCATTTCAAAAAAGAAAAGAAAAACTTGTTTTTGAAGAGTTTATTCAACGAAAAGTATGTCA
    CACCAGATAATCGCCAAATATGTTTGAGTAGCACCATGTCAGCACCAATTACCATCTACTCTTACCGTGTCAACTCAGTG
    GACAATCCAGGTGTTCCTGTTGTGTTGAACTTCACTGGAACACAAAACTTTTTCAGCTGCACCACGAAGCAAGGTGCAGA
    CACGAAGATTTTAACCGTTGTGTCTTACAGTAAGAGCGAGCTGCAAAAGATCTGCGCCGGGGACACAGAGAAATGGTCAC
    TTGTGTTCTACAAGTCTTGTGGACCAGACTGTTTCCAACGGTTTGAGTCGGCTCTCCACAGAGGATGGTTTATCTGCACC
    AAAAATATTGCCAACAATGACGCGAATGTGTACATGGGCAACGGTGTTGAGCGTGACAAACCACTCAACACCTTTTTCGT
    CATAATTGAGAGTGAGAAAGCGATTTGCTAA
    Send to
    		or


    >AM260542.1 Interleukin-1 family member 2
    AAAATCACCATCTTCCATGTCATGGTCGCTGAAGACTTGAATAAAGCTAAAGCTGTTGTGTTGAACTTTACTGACACCGA
    AAACTTCTTCTGCTGTATCAACAATGGGGAAGAGACTAAGTTAACAATTAAAAGGTATAAGCAAGAACAGCTGCGCAACT
    CTACAAGTGACCCAGTAAAGCCCTCTCTTGTTTTCTACATGTCTCAAACCCCGGATGGTTTCTATCATTTTGAGTCTGCT
    CTCCACAGAGGATGGTTCCTTCACACTGTAAAC
    Send to
    		or



    Organism

    GO term(s)

    Gene Expression

    Gene Structure

    Possible Primers

    Phylogeny (Gene Tree)

    Synteny

    Genomic Map Locations

    Paralogs

    Sequencing Methods

    Citations

    Sequence

    Gene Domains

    Molecular Markers


    CLICK IMAGES
    FOR LARGER SIZE